Podem distinguir-se duas partes no corpo de um percebe: o capitulum (unha) e o pedúnculo.

O capitulum é formado por várias placas calcárias e em diferente número que geralmente aumenta com a idade do percebe. A distância entre as placas rostrum e carina (distância RC) é muito utilizada para definir o tamanho de um percebe.

No interior do capitulum encontram-se os cirros que servem para capturar os alimentos.

No capitulum encontra-se também a boca e restantes órgãos do aparelho digestivo, e órgãos do aparelho sexual masculino.

No interior do pedúnculo encontra-se tecido muscular, parte do aparelho sexual feminino e as glândulas produtoras do cimento através do qual este animal se fixa ao substrato.